A continuació trobareu el contingut de les sessions en Power Point. Els alumnes que han vingut a classe ja saben quins errors hi ha en alguns fitxers però els que no heu vingut tingueu en compte que n'hi ha.

Algorismes de cerca

  1. Sessió 1: Força bruta, Horspool i BNDM
  2. Sessió 1: Força bruta, Horspool i BNDM
  3. Sessió 2: BOM
  4. Aplicacio BOM
  5. Sessió 3: Set Horspool, Wu-Manber i SBOM
  6. Sessió 4: Extensions de patrons
  7. Sessió 5: Expressions regulars
  8. Sessió 6: Suffix trees i Suffix arrays
  9. Sessió 7: Cerca aproximada i distància d'edició
  10. Aplicació algorismes de bioinformàtica
  11. Sessió 8: Algorisme d'aliniament de seqüències
  12. Sessio 9: Algorisme d'aliniament de seqüències II
  13. Sessió 10: Seqüenciació i engalçament de seqüències
  14. Sessió 11: Hidden Markov Models


  15. Examen parcial quadrimestre hivern 07-08
  16. Examen final (2a. part) quadrimestre hivern 07-08
  17. Examen parcial quadrimestre primavera 06-07
  18. Examen parcial quadrimestre hivern 06-07
  19. Examen parcial quadrimestre primavera 05-06
  20. Examen final quadrimestre primavera 05-06
  21. Examen parcial quadrimestre hivern 05-06
  22. Examen final quadrimestre hivern 05-06
  23. Examen parcial quadrimestre hivern 04-05

Sessions de laboratori

Bases de dades

  1. Virus: equineherpesvirus: 152168bps
  2. Bacteri: Chlamydophila-pneumoniae: 1.247492bps
  3. Escherichia_coli_K12: 4.705564bps
  4. Drosophila, cromosoma 1:22.027427bps

Sessió 1: Algorismes de cerca d'un mot

  1. 1a sessió de laboratori.
  2. Algorisme Força bruta
  3. Algorisme de Horspool
[

Sessió 2: Comparació de sequencies

  1. 2a sessió de laboratori.
  2. Seqs.fa

Sessió 3: Hidden markov models

  1. 3a sessió de laboratori.
  2. Paquet de programes
Go to Personal Home Page | Go to LSI-IT Home Page | Go to LSI Home Page | ]

messeguer@lsi.upc.es

Ultima actualització 10 de setembre de 1997