Accions del document

Ignasi Belda, proteïnes amb intel·ligència artificial

L'Ignasi Belda és un jove de 28 anys molt emprenedor. El seu inconformisme l'ha dut a formar-se a diferents universitats tant nacionals com internacionals i a crear la seva pròpia empresa Intelligent Pharma, intel·ligència artificial aplicada al món biomèdic i farmacèutic.

Un matí amb l'Ignasi Belda

Visitem el Parc Científic i entre obres i reformes ens trobem a l'Ignasi Belda, qui en uns dies presentarà la seva tesis doctoral del Programa de Intel·ligència Artificial i podrà estrenar oficina per a la seva empresa, Intelligent Pharma.

Explica'ns la teva trajectòria...

Coneixem l'anar i devenir de la teva tesi, i quina és la ciència que hi ha al darrera?

Jo sóc d'Alacant i per a mi va ser molt positiu venir a la gran ciutat. Jo vaig arribar a Barcelona, l'any 1997, per estudiar Enginyeria Tècnica en Informàtica de Sistemes a La Salle de la Ramon Llull.

Quan estava cursant 3er de carrera vaig decidir començar un treball de recerca amb l'Ernest Giralt, un del directors de la meva tesi en l'actualitat, en Intel·ligència Artificial aplicada a l'optimització de pèptids.

La informàtica m'agradava així que vaig decidir continuar al meva formació matriculant-me en enginyeria superior. Durant aquests anys combinava l'estudi amb la recerca iniciada amb l'Ernest. De fet, fou precisament ell qui m'animà a seguir encara més i iniciar el doctorat que ara he acabat.

Podríem dir que la teva tesi té molts pares. Com ens ho explicaries?

Sí, francament el meu cas és una mica curiós, tot i que en realitat ha anat succeint de forma natural.

Ignasi

Jo vaig començar a fer recerca sota la direcció de l'Ernest Giralt, catedràtic de química orgànica a la Universitat de Barcelona, per tant aquest fou l'origen del meu doctorat. Passat poc temps es va inaugurar el Parc Científic de Barcelona, i l'Ernest s'hi va traslladar; donant així una segona llar a la meva tesi. Per tal de poder continuar investigant en el camp que a mi m'interessava, la Intel·ligència Artificial, vaig decidir seguir els cursos de doctorat que ofertava el departament de Llenguatges i Sistemes Informàtics (LSI) de la UPC i l'Àngela Nebot esdevingué la tutora de la meva tesis. Per altra banda, també vaig trobar ajuda en el món de la intel·ligència artificial i en el desenvolupament d'algorismes de la mà d'en Xavier Llorà. En Xavier és professor a la University of Illinois at Urbana-Champaing i ha estat co-director de la meva tesi. Durant aquests anys s'ha posat en marxa l'Istitut de Recerca Biomèdica (IRB) i l'Ernest Giralt ha estat nomenat un dels directius d'aquesta proposta. D'aquesta manera jo també quedava vinculat a IRB. Finalment, la meva estança a AstraZeneca, una empresa farmacèutica sueca capdavantera a nivell mundial va donar les últimes pinzellades a la meva investigació i la sisena institució a qui agrair la possibilitat dels meus estudis.

Sí, si no m'he descomptat, aquests sis centres són els pares doctorals de la meva tesi.

Com us he comentat abans, la meva especialitat és la intel·ligència artificial aplicada a biomedicina. El títol de la meva tesi és: Evolutionary Algorithms and de Novo Peptide Design.

Podríem dir que està estructurada en dues parts. Una part majoritària relacionada amb la computació evolutiva aplicada al disseny de pèptids. En aquesta primera part he generat algorismes evolutius per optimitzar l'energia d'enllaç entre pèptids i determinades proteïnes. Els biòlegs i els bioquímics que treballen en l'equip de recerca del qual jo en formo part, necessiten generar i conèixer els tipus de pèptids que s'adhereixen a aquestes determinades proteïnes. Jo els aporto simulacions que els ajudaran en l'obtenció de resultats reals.

Parteixo de la teoria Darwinista de la Selecció Natural i inicio la feina generant una sèrie de pèptids, o seqüències d'aminoàcids, aleatoris. Simulo com aquests pèptids s'enganxen a les superfícies triades i gracies al docking avaluo l'adaptació dels pèptids en funció de l'energia alliberada en l'enllaç. D'aquest primer procés trio els millors pèptids i genero mitjançant creuaments una segona generació de pèptids que tornarem a avaluar. De fet, aquesta metodologia està basada en un procés iteratiu. A més, introdueixo de tant en tant mutacions aleatòries. Segueixo doncs, el model de la evolució de la vida al nostre planeta Terra. Aquesta manera de treballar es basa en la utilització d'algorismes genètics que formen part de la computació evolutiva.

Part de la meva recerca també ha estat encaminada a millorar el docking, que és en sí mateix un algoritme genèric. La meva intenció ha estat aconseguir una major qualitat i rapidesa. Tota aquesta feina és força costosa des del punt de vista computacional. I cal tenir en compte que per desenvolupar la part d'avaluació ha estat necessari treballar amb el Mare Nostrum i cinc-cents processadors a l'hora.

Per altra banda, la meva estança a Suècia ha significat la incorporació de l'aprenentatge artificial com una branca més del meu arbre doctoral. AstraZeneca és una empresa amb quatre mil investigadors i on s'inverteixen catorze milions de dòlars en recerca diaris. Com a empresa farmacèutica està interessada en la toxicitat de determinades molècules. La meva aportació va consistir en desenvolupar un programa capaç de dir si una molècula és tòxica o no i per què. Per fer-ho utilitzo algoritmes evolutius amb regles o paràmetres: càrregues elèctriques, hidrofobicitat, ...etc. Treballo amb més de mil cinc-cents paràmetres físico-químics i així obtinc informació en relació a què tenen en comú les molècules tòxiques. Així, els químics mèdics poden evitar aquestes característiques en el disseny de noves molècules. Aquestes troballes i el desenvolupament d'algorismes evolutius amb paràmetres representen el darrer 10% de la meva tesi.

Què és Intelligent Pharma?

Intelligent Pharma és una empresa d'informàtica aplicada a la biomedicina situada a Barcelona, i en concret al Parc científic de Barcelona. L'objectiu de la companyia és desenvolupar software altament especialitzat per a aportar millores basades en el camp de la intel·ligència artificial, empreses farmacèutiques, biomèdiques,...etc.

La idea de muntar una empresa va anar prenent forma al llarg d'aquests darrers anys de la meva vida; de fet, podríem dir que Intelligent Pharma va néixer l'endemà de dipositar la meva tesi doctoral, un solejat Sant Jordi de l'any 2007. Tot i així, personalment penso que ser emprenedor és quelcom que es duu a dins; els meus pares són empresaris i jo sabia que volia arribar a aquest punt en començar la carrera.

IBtraje

La gent creu que Intelligent Pharma està molt lligada a la feina que jo he estat fent aquests darrers anys, però en realitat està basada en l'aprenentatge i el bagatge que he aconseguit. En aquest temps, he descobert, i crec que la gent no n'és prou conscient, que l'àmbit de la salut hi ha una gran demanda d'informàtics. Fer una empresa és un procés lent, no us enganyaré i requereix empenta valor i un finançament previ, però també volia animar a la gent que s'ho estigui plantejant comentant que un cop et llences trobes moltes ajudes i suport. El Parc Científic, per exemple, té un programa anomenat bioincubadores i cedeix les seves instal·lacions a les empreses nou nascudes. Existeixen entitats bancàries com BanCaixa que organitzen concursos per a joves emprenedors, Intelligent Pharma va guanyar la seva darrera convocatòria. La UPC també dóna suport amb la seva iniciativa Innova, i així un llarg llistat d'institucions desitjoses de fer avançar la ciència, l'economia i a les persones.

Amb esforç i ganes tot esdevé possible!.

Contacte premsa:

ilapuente@lsi.upc.edu

Personal tools

Accions del document

Ignasi Belda, proteïnes amb intel·ligència artificial